（1）直接参与植物新陈代谢。植物可以直接吸收简单糖类、氨基酸、腐殖酸等有机物，这些有机物直接参与到植物内部转化、代谢、合成等生物化学过程。（2）提高矿物质元素有效性和肥料利用率。腐殖酸中大量的有机酸类等，使土壤中难溶性矿物质养分转成可溶，有利于同亲脂性和细胞膜亲和，提高矿物质营养元素的有效性。（3）提高作物抗性。腐殖酸中水溶性多糖可调节植物细胞质浓度，降低冰点使植物抗寒，生物碱、酸类物质抵御或杀灭病原菌和有害昆虫，增强植物抗病虫能力。（4）激活、增加土壤有益微生物。腐殖酸为土壤微生物提供了充足的营养，使土壤微生物种群和数量增加。（5）改善土壤理化性质。腐殖酸中的活性有机物和土壤矿物质形成有机胶体，促使土壤团粒结构形成，可全面改善土壤水、肥、气、热状况。可以看出，它的优点是含有非常丰富的有机质、腐殖质和植物搜需要的很多种营养元素。有机肥它可以改良土壤和改善土壤中的重金属，可以提高土壤的结构、提高土壤的营养元素、增强土壤保肥保水能力、调节土壤酸碱度、促进土壤微生物活动、提高土壤养分有效性等都具有良好的作用。

种养结合和堆肥执行标准的实施，并不意味着商品禽畜粪便有机肥将面临重创，反而对企业是个好事。分析得出：“该标准要求养殖企业必须对禽畜粪便进行无害化堆肥处理，有机肥企业在加工该类肥料的时候反而会省去很多环节。企业通过深层次加工处理的商品有机肥作用会更加全面，肥效、利用率等都会在不同程度上有所提高，对土壤健康也会更加有利。有机肥企业可将省下来的精力更多投入到技术创新、研发等方面。” 据透露，此项堆肥标准有些指标相对较低，如水分质量分数≤45%即可。一方面农户可直接跟养殖场对接采购使用，另一方面利于厂家在堆肥原料上深层次加工。而那些没有能力做堆肥处理的小型养殖场甚至可以与有机肥厂合作共建堆肥设施。

农家肥是一种有机肥，它肥效供应新型扬粪机持久均衡，可改善土壤结构，提高土壤肥力。它既能改善土壤物理性和化学性生物活性，又能使土壤中水、肥、气达到协调，特别是对发展有机农业、绿色农业和无公害农业有着重要意义。目前国内厩肥在田间的抛撒作业还处于人工作业的阶段，抛撒效率低，抛撒不均匀，劳动强供应新型扬粪机度大。现介绍由大连雨林灌溉设备有限公司研发的双立柱螺旋式撒肥机，双轴横螺旋式抛撒机，双圆盘撒粪机。这一系列撒肥机器，可以充分实现有机肥及禽畜粪便的全方位、高效、均匀抛撒还田，大力节省人力，提高抛撒效率，解决禽畜粪便堆肥及污染问题，为有机绿色生态农业提供全强力支持。

随着畜禽养殖总量和养殖场户规模的不断扩大，畜禽粪污的产生量也不断增加。但是如果想完成环保要求，对资金的需求量有很大，养殖业上规模速度快，种植业上规模速度慢。这就导致种养结构失衡，进而导致规模养殖产生的粪污难以实现规模化处理。要按照“以地定畜”的原则，需减则减，需调则调，宜养则养，实现优化布局、转型升级。养殖粪污本身不是污染，不加以利用才会变成污染，但利用好了则会变成非常安全的绿色有机肥，可以替代或减少化肥在种植业中的用量。安徽农业大学动物科技学院教授、省现代生猪产业技术体系首席专家殷宗俊认为，将养殖污染变成有机肥，必须具备以下几个方面：一是适度规模养殖，减少单个养殖场的排污量；二是养殖场要有充足的土地和种植业配套，实施种养结合；三是建立有机肥替代化肥使用的激励机制，推动有机肥在农业生产中的应用。