1.有机肥养分不均衡，氮磷钾含量偏低，且在土壤中分解较慢，虽然养分种类较多，但比不上养分单一的化肥不能满足作物高产优质的需要。在施用有机肥时应根据作物对养分的要求配施化肥，将有机肥与化肥配合施用，取长补短，发挥各自的优势，在数量和时间上满足作物对各种营养元素的需要。即使生产绿色食品的农田也要配施适量矿物肥，并在作物生长期间配合喷施海精灵（生物刺激剂）优质叶面肥，保证作物营养需求。2.有机肥不宜与碱性肥料混用，以免造成氨的挥发，降低有机肥养分含量。有机肥含有较多的有机物，也不宜与硝态氮肥混用。3.不要过量使用有机肥。过量使用有机肥会导致以下情况发生：烧苗、致使土壤中磷、钾等养分大量集聚，造成土壤养分不平衡；土壤中硝酸根离子集聚，致使作物硝酸根盐超标，土壤溶液浓度高，不利于根系吸水。

堆肥标准的实施对禽畜粪便有机肥企业来讲既是一次调整，同时也是一次提升。一方面种植业对禽畜粪便有机肥的消纳量将决定养殖的规模，超出消纳量的养殖企业根据需要在养殖结构上做出一定调整，禽畜粪便或是做沼气处理成为能源，或是做有机肥；另一方面，以前有机肥企业都是盲目去做量的发展，只设最低产能下限却没有设置上限。未来商品有机肥产能过剩的企业就需要下调或者将超出的产能通过技术升级方式制成高端产品，销往其他市场，也可以与当地没有加工技术的养殖场合作共赢。中国农业大学教授也认为，执行标准中要求的源头处理可使有机肥企业简化加工程序，更多投入到技术创新、产品升级上来，将更加利于整个禽畜粪便有机肥行业的发展与壮大。

由于农业的现代化水平越来越高，有机食品越来越受到了人们的重视。随之重视的便是生态农业。因为只有生态的农业才能生产出生态的食品。在这一方面，无论是从国家政策支持的力度上，还是在实际的行动中，国家都对此投入大量的支持。现在我们所了解的有机肥的广泛应用就是一个最好的说明。可以说，有机肥以后将逐渐取代其他的肥料，而成为农作物生长中的一个必备的肥料。在有机肥的生产方面，得到了很多专家的大力支持。同时在设备上，也得到了国家的大力支持。很多地方都有有机肥生产的专门的设备和生产专线，以便能够生产出更好的有机肥。在政策支持上，很多地方政府更是给了很多帮助。尤其在利用废弃物、处理一些废弃的生活用品方面得到了大力的支持，因为这样做一方面不仅处理了生活垃圾，减少了环境污染，而且另一方面也变废物为宝贝，生产出了有价值的有机肥。在很多地方，这都是一个非常好的举措，所以，很多地方政府都会对有机肥的生产和使用给予大力的支持，甚至还从经济上进行一定不补贴，以鼓励人们使用有机肥。可以说，正是有机肥的广泛使用，才能使得我们的农业逐步的开始向无公害农业转变，才能使得让更多的有机食品、水果、蔬菜走向我们的餐桌。

以往老百姓种田都是靠人工施肥，这样的施肥方式即费力又费时，同时还达到我们预计的施肥效果。随着时代的进步，坚持抛粪机走科技强农的发展战略，撒肥机问世了。在我国以往施肥大多将腐熟好的肥料用大车运输到田间均匀放成小堆，再用锹撒开。也有在大车上随走随撒的。这种方法劳动生产率很低，且撒肥不匀。由于土地长期大量施用化学肥料，造成土壤中某些营养成分的严重缺乏，土壤板结，影响了农作物供应抛粪机厂家直供产品的品质。采用撒肥机撒肥可以更好的提高劳动生产率，并可提高撒肥质量，这样一来，就避免了施肥不均匀的现象，不仅使农作物的产量增加，同时也克服了土壤局部板结的问题，最最主要的是为老百姓节约了种田成本。